北京農業職業學院溯源于1958年建校的北京市農業學校；2001年6月，北京市農業學校和北京市農業管理干部學院合并組建北京農業職業學院；是經北京市人民政府批準、國家教育部備案的全日制公立普通高等學校，學校是國家示范性高等職業院校，現代學徒制試點單位，全國文明單位和北京市職業教育先進單位。2008年7月，被確定為第三批國家示范性高等職業院校建設單位。學院榮獲“北京新型農民培養先進單位”、“社會力量參與社會主義新農村建設先進單位”等榮譽稱號。

2020年簽訂“圖書消毒柜項目”。